En biologia, per descriure un organisme concret, que pertany als regnes dels animals, fongs o plantes, s'ha desenvolupat la seva pròpia nomenclatura. Reflecteix la pertinença a una espècie, en funció de les característiques de morfologia i aspecte. Per als animals s'apliquen els criteris de referència a una espècie, en funció de la capacitat de produir descendència fèrtil durant la fecundació. Tanmateix, aquests patrons s'apliquen només a aquests organismes, mentre que els microbis no es poden classificar d'aquesta manera.
El concepte de soca en microbiologia
A causa de la presència d'un gran nombre d'organismes que tenen propietats morfològiques, però diferents característiques bioquímiques i immunològiques, és impossible aplicar la nomenclatura estàndard per a la denominació. Com a resultat, es va introduir un concepte com a soca. Es tracta d'un cultiu pur de microbis que s'ha aïllat i aïllat en un lloc determinat a una hora determinada.
Cada microbi que pertany a una soca és semblant a un altre representatiu pel que fa a criteris bioquímics, morfològics, immunològics i genètics. Però dins de la mateixa espècie bacteriana, aquesta analogia no s'observa. Per tant, una soca és un nom més flexible per a un cultiu microbià. Perquè ràpidl'intercanvi de material genètic (mutació) porta a l'aparició de nous organismes dins d'una espècie, però amb propietats diferents, és aquesta definició la que ens permet caracteritzar amb més precisió els factors de patogenicitat i virulència.
Soques bacterianes
La nomenclatura existent de bacteris permet classificar els tipus d'organismes, però no en caracteritza les noves propietats. Aquests últims apareixen com a conseqüència d'una ràpida mutació, adquirint noves propietats, incloses les patògenes per a humans, animals de granja i plantes, així com altres microbis. Un exemple de nomenclatura utilitzant l'exemple d'Escherichia coli té aquest aspecte: regne - bacteris, tipus - Proteobacteris, classe de proteobacteris gamma, ordre - Enterobacteris, família d'enterobacteris. El gènere és Escherichia i l'espècie Escherichia colli. No obstant això, hi ha molts cultius de bacteris de l'espècie Escherichia colli, que mostren diferents propietats. Estan aïllats en soques de bacteris separades i tenen un nom addicional. Per exemple, Escherichia colli O157:H7.
La mateixa
E. coli està present a l'intestí humà i no causa cap mal altia, però la soca O157:H7 és exclusivament patògena a causa de la presència d'un gran nombre de factors de virulència. Ha patit una epidèmia de mal alties enterotoxigèniques en els últims 5 anys.
Soques de virus
El concepte de soca és un nom flexible per als organismes amb les mateixes propietats que van ser aïllats, i després identificats i descrits en una àrea determinada en un moment determinat. Amb el seu curs, el virus pot adquirir noves propietats a causa de l'antigènicderiva. Això crearà una nova soca viral, possiblement més patògena que la seva progenitora.
Podeu mostrar clarament l'aparició de noves soques utilitzant l'exemple del virus de la grip. Pertany a la família dels Orthomyxovirus i rep el nom en funció dels antígens (hemaglutinines i neuraminidasa) HxNy. X i Y són valors numèrics que reflecteixen la presència d'antígens. Un exemple és el H5N1, conegut per la recent epidèmia de grip porcina amb pneumònia hemorràgica ràpidament progressiva. Segons la teoria, a partir d'aquesta soca es pot desenvolupar una soca nova i més perillosa a causa de la mateixa deriva antigènica.
Soques de fongs i soques de protistes
Els motlles són els microbis menys variables, tot i que la seva bioquímica també és complexa. A causa d'una estructura més complexa que els bacteris i virus, i també per la manca de mecanismes de transferència ràpida de gens, el nombre de noves soques de fongs augmenta lleugerament. També hi ha l'opinió que qualsevol soca de fongs recentment descoberta és un organisme preexistent que simplement no va conèixer als investigadors.
Una situació semblant existeix al regne dels protistes. La seva capacitat de mutar és baixa, de manera que la probabilitat que apareguin noves soques ràpidament és extremadament reduïda. Tanmateix, encara apareixen noves variants d'organismes de la mateixa espècie. Per tant, pel que sembla, també existien abans, però no es van descobrir.
